Diagnostische Herausforderungen innerhalb der Bacillus cereus-Gruppe
Diagnostische Herausforderungen innerhalb der Bacillus cereus-Gruppe
Die Bacillus cereus-Gruppe (B. cereus sensu lato) umfasst häufige, in der Regel avirulente Arten, die in der mikrobiologischen Routinediagnostik oft als Kontaminanten von Patientenproben angesehen werden, sowie den hochvirulenten B. anthracis. Hier beschreiben wir 16 Isolate von 15 Patienten, die mit Hilfe einer MALDI-TOF MS-Standarddatenbank als B. cereus-Gruppe identifiziert wurden. Die Analyse der Gesamtgenomsequenzierung (WGS) identifizierte fünf der Isolate als B. anthracis-Spezies, die nicht die typischen Virulenzplasmide pXO1 und pXO2 tragen, vier Isolate als B. paranthracis, drei als B. cereus sensu stricto, zwei als B. thuringiensis, eines als B. mobilis und ein Isolat repräsentiert eine bisher unbestimmte Bacillus-Spezies (B. basilensis sp. nov.). Eine detailliertere Analyse unter Verwendung alternativer MALDI-TOF MS-Datenbanken, biochemischer Phänotypisierung und diagnostischer PCRs ergab weitere widersprüchliche Speziesergebnisse. Diese Fälle verdeutlichen die Schwierigkeiten bei der Identifizierung von avirulentem B. anthracis innerhalb der B. cereus-Gruppe mit Standardmethoden. WGS und alternative MALDI-TOF MS-Datenbanken bieten eine genauere Speziesidentifizierung, werden aber bisher nicht routinemäßig angewendet. Wir diskutieren die diagnostische Auflösung und die Diskrepanzen der verschiedenen Identifizierungsmethoden.
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